ราฟาเอล โฮลซ์เฮาเซอร์ เริ่มต้นเป็นนักเตะฝึกหัดสับสโมสร ราปิด เวียนนา ในออสเตรีย ก่อนจะย้ายไปเล่นในบุนเดสลีกา เยอรมัน กับเฟาเอฟเบ สตุ๊ตการ์ท และ เอฟเซ เอาก์สบวร์ก โดยลงเล่นในลีกเยอรมันไปรวม 36 เกม ก่อนจะย้ายกลับมาอยู่กับ ออสเตรีย เวียนนา ในปี 2014
มิดฟิลด์วัย 29 ปี ลงเล่นไป 146 นัดในลีกออสเตรีย ทำไป 29 ประตูกับอีก 33 แอสซิสต์ และติดทีมชาติออสเตรีย ไป 2 นัด
หลังจากลงเล่นช่วงสั้น ๆ กับกราสฮ็อปเปอร์ ซูริค ในสวิตเซอร์แลนด์ เขาย้ายมาเล่นกับเบียร์ช็อต ในปี 2019 ก่อนจะทำไป 27 ประตู 32 แอสซิสต์ ใน 98 เกม